В статье проанализированы характерные этиопатогенетические особенности распространения и проявления желудочно-кишечных заболеваний новорожденных телят с учетом предрасполагающих и способствующих факторов антропогенного риска региона. Производственно-экономические показатели современного животноводства, в силу отличительного многообразия его входных зависимостей от других базовых секторов экономики федерального и регионального уровней, повышенной чувствительности к качеству и полноте финансового, правового, научного сопровождения и менеджмента, являются комплексным результативным выражением эффективности, сбалансированности и инноваций восприимчивости всей социально-экономической системы и стабилизации агропромышленного комплекса. Важным направлением в решении продовольственной безопасности России остается снижение заболеваемости и гибели молодняка, получение и выращивание здорового приплода продуктивных животных. Однако, как показывает практика, существующий в настоящее время комплекс экологических, технологических, зоогигиенических, ветеринарно-санитарных решений при содержании и кормлении стельных коров-матерей в сухостойный период, проведении отелов, выращивании телят в молочный период; несвоевременность проведения специфических лечебно-профилактических мероприятий не позволяют получать новорожденных телят с высоким уровнем обмена веществ и иммунной резистентностью. Широкое и бесконтрольное применение антибактериальных средств приводит к снижению их терапевтической эффективности, к накоплению в окружающей среде и организме телят антибиотико-резистентных штаммов и является причиной аллергических реакций к данным препаратам среди животных и людей. Такие обстоятельства являются основной причиной недостаточно высокой эффективности коммерческих вакцин и аутовакцин, а также традиционно осуществляемой этиотропной терапии заболевших телят. В данных исследованиях нами показана перспективность инновационного направления по созданию новых технологий супрамолекулярных систем/комплексов для получения высокоэффективных субстанций лекарственных средств против возбудителей инфекционных болезней.