В статье предложен теоретический подход построения схемы морфологического моделирования запаса инфекции в почве и разработаны динамические модели влияния осадков на уровень запаса инфекции в почве, в зависимости от распределения по временной и природно-экологической структурам. Установлено, что результаты исследований с учетом атмосферной циркуляции, теплового и водного балансов растений, а также применения удобрений необходимы при планировании эффективного производства сельскохозяйственных культур в Красноярском крае.